自己レスです。

今回の特養の患者さん分のエラーコードに関してですが、
「服薬管理指導料３」の「介護老人施設（特養）に入所している患者」を
摘要欄で選択していなかった単純ミスでした。
頭では理解していたつもりですが、入力の際に選択を忘れていまってしまい、エラーコードのみで慌てふためいてしまいました。

お騒がせして申し訳ありませんでした。