調剤基本料の問題と思われますので「6 基本設定」にて調剤基本料設定を確認してもらえませんでしょうか？

また、エラーの発生タイミングを詳しく教えてもらえませんでしょうか？
たとえば、
・受付一覧を開いた際
・新規受付を開始した際
・Do処方した際
・「同時受付のうち2つ目以降の医療機関」のチェックを入れた際
といったものをお願いします。