> 電子証明書の更新時期となり説明を読んでいたら、
> 「オンライン請求システムとオンライン資格確認等システムを別々の端末で
> 実施する場合＝電子証明書２枚」
> とありましたので２枚必要ということでいいのですね？
>
はい。オンライン資格確認とオンライン請求をするためには、合計2枚必要になります。

現在オンライン請求用に使われている証明書は有効期限までに更新すれば良いので、今回新規で必要となる証明書は1枚です。