支払基金のホームページの「電子レセプトの作成」に「作成の手引き」が出ています（調剤は一番下です）。

http://www.ssk.or.jp/seikyushiharai/rezept/iryokikan/iryokikan_02.html

そこの「ＲＥ」行についての記載で調剤年月は５桁の数字、先月分ですと「４２９０８」となり、作成されたＣＹＯファイルにはその通りに出力されています。ＲＰＰＭＡＮのエディター画面では「/01」が付いてしまっているようです。

また、「ＧＯ」行については「薬局単位のレセプト件数の合計を記録」とあり、例)として「単独５００、２者併用５０の時、６００」とありますので、２者併用は１件で２レセプトとカウントするルールのようです。