ＫＥＮさん、こんばんは。

自動的に計算できる仕様にはなっていませんので、５４公費の一部負担金と、それ以外の負担金（１割・２割・３割）を手動で計算して足した金額を、患者負担金額編集画面で「自薬局」にカーソルを合わせ、手動で数字を入力、「登録」→「ＯＫ」で対応してください。