スタッフに皆さんいつもお世話いただきまして誠にありがとうございます。

同一医療機関で医療機関コードが２つある場合の入力について
総合病院の処方箋で
医科の処方箋には医科の医療機関コード
歯科の処方箋には歯科の医療機関コード
と２つの医療機関コードが記載されてきました。
Ｖ３で入力する場合医師を入力する画面で医療機関コードを訂正すると
その後に受け付けた処方箋は訂正された結果が反映されると思い、
歯科の処方箋の枚数は非常に少ないので、
歯科の処方箋の時は、そのまま入力して、計算させておいて、
改めて、返礼があった時に訂正する方法で正しいコードに訂正していますが、
この方法で良いのでしょうか？
レセプト集計・電子レセ送信も大丈夫でしょうか？