>「6121706520　ニトロール錠５mg　医薬品マスターにありません。」と警告内容のところにでてきました。

最新のマスターはrpp_master812a　です。

これを使い、マスター検索するとき

ニトロール　5mg　　ではなく
ニトロール5mg　を選んで下さい。　名称とミリ数に隙間のない方です。

うまくいくと思います。