Kaoさん追試ありがとうございました。
友人のレセコンでも計算してもらいましたが変な事になりました。
じっくり考え込んでしまいましたが、結局ＤＯＳ版での計算とレセ標記を採用しました。

つまり問題なのは調剤料で、２７日分はそのままで良いとして問題は６日分です。

この場合一包化分を２剤とするともう一剤分算定できます。
一包化２１日分で２９１点、さらに４５日分１剤分が７７点。
次に２２日から４５日分までの分として、残りの４５日分から２２日分を引くと７７点から６８点を引き９点を加えます。これで調剤料がそれぞれ算定できます。

ＷＩＮ版の方がー９と表示されますがこれは間違いで９点算定できないとおかしくなるという訳です。
その際のレセ上での標記はＤＯＳ版で表示されるように、４５日分の一方は７７点としてそのまま表示して、他方の４５日分に付いては、２１日分をまず標記し、残り分を
一包化２１日残り分としてと言う記述に成らないといけないはずです。

ＤＯＳ版とＷＩＮ版両方をお使いの方試してみてください。