２科から処方箋がきて、１科が一包化、他方が内服の場合、内服の処方医に照会して確認を取り、対応する。一包化の指示をいただければすべて一包化と考えてレセ請求をすることは問題ないです。
　一包化の指示がなくて、別包にした場合の対応については、レセ請求は、２枚の処方箋であっても１枚の処方箋として扱い、一包化となり、内服薬の調剤料は算定できないと思います。一包化の算定は出来ると思います。