当方ではパッケージ版ATOK17を使用していますが、特に問題なく使えています。
日本語で入力の必要のあるところは全角ひらがな入力に、数字の必要なところは直接入力に自動で切り替わっています。
ATOKが使えないというのはどのあたりの事なのでしょうか。
Windows標準のMS-IMEを使わない設定にしていることが関係あるんでしょうかね。