金魚さんへ

説明がややこしくてすいません。

分割してimportし、最後に以下の操作をします。
②そのimportしたファイルをSTMホルダーに一つにまとめます。
　（１００ずつのファイル？個を一つにまとめます。）
③一括してimportする。

つまりもう一度最初から、分割したファイルを一つにしてimportし直す作業をします。
単純に分割してimportするとoverwriteされるだけで、ご指摘のとおり全体のファイルは
importされません。

このやり方も上手くいかないときもあるので完璧とはいえません。
今回金魚さんが選択された方法がBESTかと思います。